Продукти

Инфрачервената спектроскопия е използвана за картографиране на взаимодействията субстрат-протеин: конформационните промени на саркоплазмения ретикулум Ca(2+)-ATPase при нуклеотидно свързване и ATPase фосфорилиране се наблюдават с помощта на субстратния ATP и ATP аналози (2'-deoxy-ATP, 3 '-дезокси-АТР и инозин 5'-трифосфат), които са модифицирани при специфични функционални групи на субстрата.Модификациите на 2'-OH, 3'-OH и аминогрупата на аденина намаляват степента на индуцирана от свързване конформационна промяна на ATPase, като особено силни ефекти се наблюдават за последните две.Това демонстрира структурната чувствителност на комплекса нуклеотид-АТФаза към индивидуалните взаимодействия между нуклеотид и АТФаза.Всички изследвани групи са важни за свързването и взаимодействията на дадена лигандна група с ATPase зависят от взаимодействията на други лигандни групи.Фосфорилиране на АТФ-азата се наблюдава за ITP и 2'-дезокси-АТР, но не и за 3'-деокси-АТР.Няма пряка връзка между степента на конформационната промяна при нуклеотидно свързване и скоростта на фосфорилиране, което показва, че пълната степен на ATP-индуцираната конформационна промяна не е задължителна за фосфорилирането.Както се наблюдава за нуклеотид-ATPase комплекса, конформацията на първото фосфорилирано ATPase междинно съединение E1PCa (2) също зависи от нуклеотида, което показва, че ATPase състоянията имат по-малко еднаква конформация от очакваното по-рано.