Продукти

Неалкохолното мастно чернодробно заболяване (NAFLD) има широк спектър от болестни състояния, вариращи от лека стеатоза, характеризираща се с необичайно задържане на липиди в чернодробните клетки до стеатохепатит (NASH), показващ натрупване на мазнини, възпаление, балонизиране и разграждане на хепатоцитите и фиброза.В крайна сметка стеатохепатитът може да доведе до чернодробна цироза и хепатоцелуларен карцином. В това проучване ние анализирахме три различни щама мишки, A/J, C57BL/6J и PWD/PhJ, които показват различни степени на стеатохепатит, когато им се прилага 3,5-диетоксикарбонил Диета, съдържаща -1,4-дихидроколидин (DDC).Анализът на генната експресия на RNA-Seq, протеиновият анализ и метаболитното профилиране бяха приложени за идентифициране на диференциално експресирани гени/протеини и нарушени метаболитни нива на проби от черен дроб на мишки при DDC-третиране.Анализът на пътя разкрива промяна на метаболизма на арахидоновата киселина (AA) и S-аденозилметионин (SAMe) при други пътища.За да се разберат метаболитните промени в метаболизма на арахидоновата киселина в светлината на профилите на експресия на болестта, беше разработен и оптимизиран кинетичен модел на този път според нивата на метаболитите.Впоследствие моделът беше използван за изследване in silico на ефектите на потенциални мишени на лекарството за стеатохепатит. Ние идентифицирахме метаболизма на AA/ейкозаноид като силно нарушен при DDC-индуцирани мишки, използвайки комбинация от експериментален и in silico подход.Нашият анализ на метаболитния път на АА/ейкозаноид предполага, че 5-хидроксиейкозатетраеновата киселина (5-HETE), 15-хидроксиейкозатетраеновата киселина (15-HETE) и простагландин D2 (PGD2) са нарушени в DDC мишки.Освен това демонстрираме, че динамичен модел може да се използва за качествено прогнозиране на метаболитни промени въз основа на транскриптомични данни в контекст, свързан със заболяването.Освен това, метаболизмът на SAMe беше идентифициран като нарушен поради лечението с DDC.Няколко гена, както и някои метаболити на този модул показват разлики между A/J и C57BL/6J от една страна и PWD/PhJ от друга.